[作者-王欣芮|审核-刘心月]近日,华中农业大学研究生院公布2024年华中农业大学校级优秀学位论文公示名单。我组由吴晓强同学撰写、李伟夫副教授指导的学位论文入选。

序号
| 学院 | 论文题目 | 作者姓名 | 指导教师 |
31 | 信息学院 | 基于多级结构数据的蛋白质互作预测算法探究 | 吴晓强 | 李伟夫 |
吴晓强同学的学位论文《基于多级结构数据的蛋白质互作预测算法探究》,主要提出一种基于氨基酸序列的预测蛋白质相互作用神经网络,命名为 Text-TransPPl,并对其在六个公开数据集上的有效性进行了验证。首先,对数据集进行介绍和统计分析,制定数据处理方法。其次,提出基于TextCNN 和Transformer 的蛋白质相互作用预测模型,利用这一模型实现从蛋白质序列的局部到整体提取特征,其次将其应用于蛋白质相互作用的预测。实验结果表明,Text-TransPPI在各数据集上均表现出良好的预测结果,平均达到准确率96.88%,精确率97.37%、召回率96.39%、F1指数96.87%和 AUC 指数0.99,这表明了模型在分类能力上的优越性和稳定性。与其他先进的 PPI预测模型相比,Text-TransPPI 在多个指标上表现出了良好且稳定的成绩。最后,通过绘制氨基酸重要性热力图并解释,进一步证明了模型的有效性。其次,本研究在 Text-Trans 的基础上修改,将蛋白质的氨基酸序列作为主要信息来源,辅以蛋白质的Domain 和结构数据,建立“一主二辅”蛋白质相互作用预测模型。与单序列模型相比,“一主二辅”模型的F1等指标平均提高了1%。
祝贺荣获优秀硕士学位论文的同学!同时向勤勉敬业、倾心付出的各位导师表示诚挚感谢!